Este prima ctitorie a lui Stefan cel Mare, destinata sa fie locul de inmormantare al marelui domn si al familiei sale. Construita intre anii 1466 si 1481, trebuia sa fie si principala instiutie eclesiastica a tarii, care sa-l sprijine pe domn pe taram cultural si religios in politica sa de neatarnare si de intarire a statului. Soarta lacasului a fost, parca retraind simbolic clipele de restriste sau de marire ale intregii tarii, extrem de agitata. Biserica, inceputa in 1466, in momentul in care Stefan ajunsese la o anumita siguranta a domniei, a fost terminata trei ani mai tarziu - in 1469, sisfintita abia in 1470, dupa ce domnul repurtase cateva victorii si eliminase pe Petru Aron, ucigasul tatalui sau si rivalul sau la scaunul tarii.

Legenda spune ca domnul a ales locul tragand cu arcul. Dar dincolo de legenda se intrezaresc realitati istorice mai substantiale. Locul fermecator de la poalele Obcinei Mari, acolo unde se deschide Valea Putnei varsandu-se in raul Suceava, era poate un mai vechi loc de calugarie, asa cum ar fi dovedit-o pomenirea de catre Neculce a unei biserici de lemn anterioare, precum si existenta in apropiere a unei bisericute sapate in stanca, asa numita chilie a lui Daniil Sihastrul.

Muzeul manastirii Putna prezinta cel mai important centru de cultura si creatie artistica medievala din Moldova. Colectia de broderii (piese caracteristice vremii), adevarate capodopere ce au facut onoare multor expozitii internationale, este cotata printre cele mai valoroase din Orientul crestin (Acoperamantul de mormant al Mariei de Mangop 1477, cel mai vechi portret brodat in marime naturala din arta moldoveneasca; dreva mare, 1510 si alte patru, (1484-1500);  manuscrisele, realizari de seama ale miniaturisticii nationale, scrieri vestite pentru calitatea desenelor insotitoare, varitatea coloritului acestora, sunt reprezentate prinTetraevangheliarul de la Humor (1473) si alte doua din 1488-1507 la fel de faimoase, coborate din Scoala lui Gavril Uric (manastire Neamt) al carui Tetraevanghel (1429) se afla acum la Oxford (biblioteca Bodleyana);